Маленькая мышка Оливия теряет своего отца, известного мастера игрушек, после его таинственного похищения летучей мышью . Единственная надежда девочки — великий сыщик Бэзил с Бейкер-стрит, чьи дедуктивные таланты достойны самого Шерлока Холмса, в подвале дома которого он и живёт . Вместе с новым знакомым, отставным военным доктором Доусоном, и верным псом Тоби, Бэзил берётся за расследование . Следы ведут к профессору Рэтигану — гениальному, но безжалостному криминальному авторитету, который замышляет нечто большее, чем просто похищение . Удастся ли мышиному Шерлоку Холмсу разгадать план врага и спасти Оливию и её отца, а заодно и всё мышиное королевство?