Сюжет посвящен борьбе с тиранией. В Галактике наступили темные времена, так как Империя захватывает миры один за другим. Действие начинается на окраинной планете, где имперские войска ввели жестокий оккупационный режим.

Против оккупантов выступает команда корабля «Призрак». Это группа смельчаков, которая не готова мириться с деспотией. По сюжету им приходится сражаться с новыми опасными врагами Империи. Постепенно их локальная миссия перерастает в нечто большее: именно экипажу «Призрака» суждено разжечь пламя полномасштабного галактического восстания и стать героями Альянса повстанцев.